(NIAID/Wikimedia Commons/CC BY 2.0) 
Island má geneticky zoradené všetky svoje pozitíva COVID-19 prípadov od začiatku pandemický , čo je čoraz dôležitejšia prax, keď sa z Británie a Južnej Afriky objavujú nové znepokojujúce kmene.
The Svetová zdravotnícka organizácia v piatok vyzval všetky krajiny, aby zintenzívnili sekvenovanie genómu s cieľom pomôcť v boji proti vznikajúcim variantom.
Vedci v laboratóriu islandskej biofarmaceutickej skupiny deCODE Genetics v Reykjavíku posledných 10 mesiacov neúnavne analyzovali každý pozitívnytest na koronavírusna Islande na žiadosť tamojších zdravotných úradov.
Cieľom je dohľadať každý prípad, aby sa predišlo prekĺznutiu problémových cez sieť.
„Skutočné sekvenovanie nám trvá relatívne krátko,“ vysvetľuje vedúci laboratória Olafur Thor Magnusson a dodáva, že „približne tri hodiny“ sú všetko, čo je potrebné na určenie vírus kmeň.
Celý proces, od izolácie DNA po jej sekvenovanie, môže trvať až deň a pol a umožnil Islandu identifikovať 463 samostatných variantov, ktoré vedci nazývajú haplotypy.
Pred sekvenovaním sa najprv izoluje DNA každej vzorky a potom sa purifikuje pomocou magnetických guľôčok.
Vzorky sa potom odnesú do masívnej, svetlej miestnosti plnej vybavenia, kde sa z malých strojov pripomínajúcich skenery ozýva ohlušujúci zvuk.
Stroje sú génové sekvenátory, ktoré mapujú román koronavírus genóm.
Svetový líder
Vo vnútri každého stroja je čierna skrinka nazývaná „prietoková bunka“, sklenené sklíčko, ktoré obsahuje molekuly DNA.
Táto technológia hrá na Islande veľkú úlohu od začiatku pandémie.
„Sekvenovanie vzoriek je kľúčom k tomu, aby sme mohli sledovať stav a vývoj epidémia Minister zdravotníctva Svandis Svavarsdottir povedal agentúre AFP.
Úrady použili informácie o poradí, aby rozhodli o presných a cielených opatreniach na obmedzenie šírenia vírusu, povedala.
Zatiaľ čo juhoafrický variant nebol na Islande zistený, 41 ľudí bolo identifikovaných ako nositeľov britského variantu.
Všetky boli zastavené na hraniciach – kde sa na cestovateľoch vykonávajú testy PCR – čím sa účinne zabránilo prenosu variantu na subarktickom ostrove.
Identifikácia DNA tiež umožnila vytvoriť jasné spojenie medzi návštevníkmi krčmy v centre Reykjavíku a väčšinou infekcií v novej vlne v polovici septembra, čo viedlo úrady k zatváraniu barov a nočných klubov v hlavnom meste.
Sekvenovanie tiež identifikovalo samostatný kmeň od dvoch francúzskych turistov, ktorí mali pozitívny test pri príchode na Island a ktorí boli pôvodne mylne obvinení z toho, že sú príčinou septembrového nárastu.
Všetkých približne 6 000 prípadov COVID-19 hlásených na Islande bolo sekvenovaných, čím sa stal svetovým lídrom v sekvenovaní COVID.
Zatiaľ čo niekoľko krajín, ako napríklad Británia, Dánsko, Austrália a Nový Zéland, vykonáva vysokú úroveň sekvencovania, žiadna z nich sa ani zďaleka nepribližuje úrovniam Islandu, hoci globálne štatistiky nie sú úplné.
Detská hra
Prečo je teda Island tak ďaleko pred zápasom?
Génové mapovanie je špecialitou deCODE.
Spoločnosť bola založená v roku 1996 a vykonala doteraz najväčšiu genetickú štúdiu populácie.
Pre štúdiu z roku 2015 rakovina rizikové faktory, sekvenovala celý genóm 2 500 Islanďanov a študovala genetický profil tretiny vtedajšej populácie 330 000.
V porovnaní s tým je sekvenovanie vzoriek COVID-19 detskou hrou.
„Je veľmi ľahké sekvenovať tento vírusový genóm: je to len 30 000 nukleotidov, nie je to nič,“ vtipkuje Kari Stefansson, 71-ročný zakladateľ a výkonný riaditeľ spoločnosti.
Na porovnanie, ľudský genóm bežne analyzovaný v jeho laboratóriách pozostáva z 3,4 miliardy párov nukleotidov alebo organických molekúl, dodáva.
Zatiaľ čo dôsledné sekvenovanie na Islande bolo užitočné na sledovanie šírenia vírusu, zatiaľ to neviedlo k žiadnym veľkým vedeckým objavom pre deCODE.
„Ak sú medzi nimi rozdiely vírusy s rôznymi vzorovými mutáciami nie sú príliš zrejmé. Nie je to dostatočne zrejmé na to, aby sme to pochopili,“ hovorí Stefansson.
©Francúzska mediálna agentúra